1) Proteinů komplementu organismu kódovaný pro jeho genomu.

2) Ve svém nejzákladnějším smyslu proteomu termín označovat celkové bílkoviny kódování schopnosti organismu genomu. v provozu, se také používá k odkazují na skutečná celková exprimovaného proteinu doplňkem organismu nebo identifikovatelné proteiny jediného typu tkáně nebo buňky nebo subcelulární prostoru.

3) The proteomu je doplněk bílkovin vyjádřený v genomu. Genom je statický, proteomu neustále mění v reakci na vnější a vnitřní události.